酶底物法作為目前水中大腸桿菌檢測的最-先-進方法，相較于傳統方法具有顯著優勢：假陽性率僅為0.01，遠低于濾膜法23-26%的假陽性率，有效避免誤判；檢測時間縮短至24小時，較多管發酵法（3-5天）、濾膜法（2-3天）大幅提升效率；檢測范圍更廣，51孔定量盤檢測范圍0-200MPN/100ml（水樣不稀釋），97孔定量盤檢測范圍0-2419MPN/100ml（水樣不稀釋），可覆蓋從低濃度到高濃度的全范圍檢測，優于多管發酵法2-1600MPN/100mL的檢測范圍。